ELIXIR Germany

Seit 2016 ist Deutschland Mitglied der europäischen Bioinformatik-Infrastruktur ELIXIR Europe (European Life Science Infrastructure for Biological Information), die als zwischenstaatliche Organisation lebenswissenschaftliche Ressourcen wie Datenbanken, Softwaretools, Trainings- und Schulungsmaterialien sowie Cloudspeicher aus ganz Europa zusammenführt. ELIXIR Germany ist der vom Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF) eingerichtete nationale Knoten Deutschlands und trägt zum Aufbau einer länderübergreifenden Bioinformatik-Infrastruktur in ELIXIR bei. Auf diese Weise ist es für Forschende einfacher, Daten im Sinne der FAIR-Prinzipien (Findble, Accessible, Interoperable, Reusable) zu finden, zu analysieren und gemeinsam zu nutzen. Zudem wird ein Austausch von Fachwissen und die Implementierung bewährter Best-Practice-Verfahren in den Lebenswissenschaften ermöglicht.

Der deutsche Knoten wird von Mitgliedern des Deutschen Netzwerks für Bioinformatik Infrastruktur - de.NBI betrieben. ELIXIR Germany ist ein Zusammenschluss von 24 Vertragspartnern deutscher Universitäten und Forschungseinrichtungen. Diese Partner bieten bioinformatische Tools, Training und Cloud-Computing-Ressourcen an, mit dem Ziel, das nationale Serviceangebot mit den europäischen Partnern zu harmonisieren.

Nach sieben Jahren Projektlaufzeit wurden de.NBI und ELIXIR Germany in die Verstetigung überführt. Ab 2022 wird das Netzwerk unter der Leitung der Forschungszentrum Jülich GmbH als Mitglied der Helmholtz-Gemeinschaft geführt.



Angebote & Services

ELIXIR Germany bündelt Expertise und nationale Ressourcen über Bioinformatik-Services in den Bereichen Bioinformatik für Genomik, Metagenomik, Proteomik, Metabolomik, Transkriptomik, Lipidomik bei Menschen, Mikroben und Pflanzen, RNA-Bioinformatik, Systembiologie, relevante Datenbanken und integrative Bioinformatik sowie Forschungsdatenmanagement. Darüber hinaus betreibt ELIXIR-DE die beiden deutschen ELIXIR Core Data Resources BRENDA und SILVA

Veröffentlichungen

  • Harrow et al., ELIXIR: providing a sustainable infrastructure for life science data at European scale, Bioinformatics, 2021.
  • Ortseifen et al., Establishment of ELIXIR Germany national node and its contribution to COVID-19 research, F1000 Research, 2020.
  • Wibberg et al., The de.NBI / ELIXIR-DE training platform - Bioinformatics training in Germany and across Europe within ELIXIR, F1000 Research, 2020.
  • Belmann et al., de.NBI Cloud federation through ELIXIR AAI, 2019.
  • ELIXIR Annual Report 2022

Weitere Informationen

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ELIXIR Germany Geschäftsstelle
Institut für Bio- und Geowissenschaften (IBG-5)
Forschungszentrum Jülich GmbH

c/o Centrum für Biotechnologie (CeBiTec)
Universität Bielefeld
33594 Bielefeld